Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIB5

Barhl2, BarH-like 2 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl2Q8VIB5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barhl2Q8VIB5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Barhl2Q8VIB5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Barhl2Q8VIB5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Barhl2Q8VIB5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Barhl2Q8VIB5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms