Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dkk4Q8VEJ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dkk4Q8VEJ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dkk4Q8VEJ3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dkk4Q8VEJ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms