Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Med17Q8VCD5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Med17Q8VCD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Med17Q8VCD5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Med17Q8VCD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Med17Q8VCD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Med17Q8VCD5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med17Q8VCD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med17Q8VCD5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med17Q8VCD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms