Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC3Q8TF64 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC3Q8TF64 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GIPC3Q8TF64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GIPC3Q8TF64 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms