Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf43Q8TAL5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf43Q8TAL5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf43Q8TAL5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf43Q8TAL5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms