Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc12Q8R344 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc12Q8R344 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc12Q8R344 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc12Q8R344 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc12Q8R344 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms