Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPATA4Q8NEY3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPATA4Q8NEY3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPATA4Q8NEY3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms