Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATSPER1Q8NEC5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATSPER1Q8NEC5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER1Q8NEC5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER1Q8NEC5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms