Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM87AQ8NBN3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM87AQ8NBN3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM87AQ8NBN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms