Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ANKRD42Q8N9B4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANKRD42Q8N9B4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ANKRD42Q8N9B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ANKRD42Q8N9B4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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