Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDR16C5Q8N3Y7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR16C5Q8N3Y7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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SDR16C5Q8N3Y7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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SDR16C5Q8N3Y7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDR16C5Q8N3Y7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDR16C5Q8N3Y7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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