Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC43Q8N309 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC43Q8N309 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC43Q8N309 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC43Q8N309 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms