Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CMTR1Q8N1G2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CMTR1Q8N1G2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CMTR1Q8N1G2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CMTR1Q8N1G2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CMTR1Q8N1G2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CMTR1Q8N1G2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms