Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
OptnQ8K3K8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
OptnQ8K3K8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
OptnQ8K3K8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
OptnQ8K3K8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
OptnQ8K3K8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
OptnQ8K3K8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
OptnQ8K3K8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms