Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pacs1Q8K212 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacs1Q8K212 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pacs1Q8K212 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacs1Q8K212 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacs1Q8K212 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms