Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Afg3l2Q8JZQ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Afg3l2Q8JZQ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Afg3l2Q8JZQ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Afg3l2Q8JZQ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Afg3l2Q8JZQ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Afg3l2Q8JZQ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Afg3l2Q8JZQ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms