Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPUSD2Q8IZ73 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPUSD2Q8IZ73 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPUSD2Q8IZ73 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPUSD2Q8IZ73 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPUSD2Q8IZ73 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPUSD2Q8IZ73 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPUSD2Q8IZ73 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPUSD2Q8IZ73 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPUSD2Q8IZ73 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPUSD2Q8IZ73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms