Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC170Q8IYT3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC170Q8IYT3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC170Q8IYT3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC170Q8IYT3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC170Q8IYT3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC170Q8IYT3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC170Q8IYT3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms