Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCUBE3Q8IX30 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCUBE3Q8IX30 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SCUBE3Q8IX30 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCUBE3Q8IX30 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SCUBE3Q8IX30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCUBE3Q8IX30 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCUBE3Q8IX30 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms