Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWN7

RP1L1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1L1Q8IWN7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP1L1Q8IWN7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1L1Q8IWN7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1L1Q8IWN7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1L1Q8IWN7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms