Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APLFQ8IW19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APLFQ8IW19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APLFQ8IW19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APLFQ8IW19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APLFQ8IW19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms