Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A9Q8IVB4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A9Q8IVB4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A9Q8IVB4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9A9Q8IVB4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A9Q8IVB4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A9Q8IVB4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms