Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC71Q8IV32 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC71Q8IV32 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC71Q8IV32 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 993.2 ms