Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU6

Hectd2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD2, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd2Q8CDU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hectd2Q8CDU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hectd2Q8CDU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hectd2Q8CDU6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hectd2Q8CDU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hectd2Q8CDU6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hectd2Q8CDU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms