Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc87Q8CDL9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc87Q8CDL9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc87Q8CDL9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc87Q8CDL9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms