Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E4f1Q8CCE9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
E4f1Q8CCE9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E4f1Q8CCE9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
E4f1Q8CCE9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
E4f1Q8CCE9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms