Protein–RNA interactions for Protein: Q8C878

Uba3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba3Q8C878 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba3Q8C878 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uba3Q8C878 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba3Q8C878 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uba3Q8C878 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uba3Q8C878 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms