Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dclre1bQ8C7W7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dclre1bQ8C7W7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclre1bQ8C7W7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms