Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bhlhe22Q8C6A8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhe22Q8C6A8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms