Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S0

4932411N23Rik, RIKEN cDNA 4932411N23, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932411N23RikQ8C0S0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4932411N23RikQ8C0S0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4932411N23RikQ8C0S0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4932411N23RikQ8C0S0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4932411N23RikQ8C0S0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4932411N23RikQ8C0S0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms