Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trerf1Q8BXJ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trerf1Q8BXJ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trerf1Q8BXJ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trerf1Q8BXJ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trerf1Q8BXJ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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