Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lmod1Q8BVA4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lmod1Q8BVA4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod1Q8BVA4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms