Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smad3Q8BUN5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smad3Q8BUN5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smad3Q8BUN5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smad3Q8BUN5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smad3Q8BUN5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms