Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4aQ8BU40 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4aQ8BU40 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4aQ8BU40 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4aQ8BU40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms