Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sp8Q8BMJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sp8Q8BMJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sp8Q8BMJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sp8Q8BMJ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sp8Q8BMJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sp8Q8BMJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sp8Q8BMJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sp8Q8BMJ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sp8Q8BMJ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sp8Q8BMJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sp8Q8BMJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sp8Q8BMJ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sp8Q8BMJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sp8Q8BMJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sp8Q8BMJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms