Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nop53Q8BK35 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nop53Q8BK35 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nop53Q8BK35 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop53Q8BK35 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms