Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nup107Q8BH74 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup107Q8BH74 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup107Q8BH74 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup107Q8BH74 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup107Q8BH74 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms