Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npas4Q8BGD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Npas4Q8BGD7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Npas4Q8BGD7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npas4Q8BGD7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npas4Q8BGD7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npas4Q8BGD7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npas4Q8BGD7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npas4Q8BGD7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npas4Q8BGD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npas4Q8BGD7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npas4Q8BGD7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms