Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim65Q8BFW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim65Q8BFW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim65Q8BFW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim65Q8BFW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim65Q8BFW4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms