Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms