Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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