Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc29Q80VM3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc29Q80VM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc29Q80VM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc29Q80VM3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms