Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc155Q80VJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc155Q80VJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc155Q80VJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc155Q80VJ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc155Q80VJ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms