Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Otop3Q80UF9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Otop3Q80UF9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Otop3Q80UF9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Otop3Q80UF9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms