Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf38bQ80SY5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf38bQ80SY5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf38bQ80SY5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpf38bQ80SY5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf38bQ80SY5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf38bQ80SY5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf38bQ80SY5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38bQ80SY5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf38bQ80SY5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms