Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDF3Q7Z739 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YTHDF3Q7Z739 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YTHDF3Q7Z739 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms