Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYSMD3Q7Z3D4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LYSMD3Q7Z3D4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LYSMD3Q7Z3D4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LYSMD3Q7Z3D4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms