Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETXQ7Z333 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETXQ7Z333 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETXQ7Z333 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SETXQ7Z333 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms