Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec18aQ7TSQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms