Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccp110Q7TSH4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccp110Q7TSH4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccp110Q7TSH4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccp110Q7TSH4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms